在上海申請第二類增值電信業務許可證（EDI，即電子數據交換業務）的費用因多種因素而異，通常包括官方費用、代理服務費和材料準備成本。以下是詳細說明：

一、費用構成

1. 官方費用：向上海市通信管理局繳納的行政審批費，一般為數百元人民幣，具體金額需以官方最新通知為準。
2. 代理服務費：若委托專業機構辦理，費用在5000元至2萬元之間，取決于服務內容（如材料指導、加急處理等）。
3. 其他成本：包括企業資質準備（如注冊資本需達到100萬元人民幣）、技術方案撰寫、人員配置等，可能產生額外支出。

二、影響因素

• 企業自身條件：若企業已具備完善的財務、技術和安全體系，可降低代理成本。
• 辦理周期：加急服務可能增加費用。
• 業務范圍：EDI許可證涉及在線數據處理與交易處理，若業務復雜，費用可能上浮。

三、辦理流程

1. 準備材料：包括營業執照、法人身份證明、業務發展計劃等。
2. 提交申請：通過工信部或上海市通信管理局平臺在線提交。
3. 審核與領證：審批周期通常為40-60個工作日，通過后領取許可證。

四、建議
建議企業先咨詢官方或專業代理機構，獲取最新報價。自行辦理可節省代理費，但需確保材料齊全；委托代理則更高效，適合時間緊迫的企業。總體而言，總費用預計在1萬至3萬元人民幣之間，具體視實際情況而定。